Trente-six adultes en bonne santé, dix semaines de régime encadré, et un résultat qui a surpris les chercheurs eux-mêmes : ce ne sont pas les fibres qui ont enrichi leur microbiote, mais les aliments fermentés. Kéfir, kimchi, kombucha, choucroute, yaourt : ce sont ces produits, et non les légumineuses ou les céréales complètes, qui ont fait bouger la composition bactérienne intestinale des participants.

L’étude vient de l’école de médecine de Stanford, publiée dans la revue Cell et menée par les chercheurs Justin Sonnenburg, Erica Sonnenburg et Christopher Gardner. Le protocole était simple sur le papier : deux groupes, un même objectif (améliorer la santé intestinale), deux stratégies opposées. Gardner et son équipe ont assigné aléatoirement 36 adultes en bonne santé à un régime riche en fibres ou en aliments fermentés. L’objectif du groupe fibres : manger 20 grammes de fibres de plus par jour qu’avant l’étude, en misant sur les haricots, les légumes, les fruits et les céréales complètes. L’objectif du groupe fermenté, lui, était d’atteindre six portions d’aliments fermentés par jour, un rythme jugé soutenu mais tenable par les chercheurs.

Sommaire

1. Un verdict net après dix semaines
2. Pourquoi les fibres n’ont pas suffi
3. Ce que ça change concrètement dans l’assiette

Un verdict net après dix semaines

Le résultat a de quoi surprendre quiconque a intégré le mantra « mangez plus de fibres pour votre microbiote ». Consommer des aliments comme le yaourt, le kéfir, le fromage cottage fermenté, le kimchi et d’autres légumes fermentés, des boissons à base de saumure végétale et le kombucha a entraîné une augmentation de la diversité microbienne globale. Le groupe fibres, en revanche, n’a montré aucune évolution comparable. Aucune des 19 protéines inflammatoires mesurées n’a diminué chez les participants assignés au régime riche en fibres, et la diversité de leurs microbes intestinaux est restée stable en moyenne.

Justin Sonnenburg n’a pas mâché ses mots pour qualifier cette découverte. « C’est une découverte stupéfiante », a-t-il déclaré, ajoutant qu’elle « fournit l’un des premiers exemples de la façon dont un simple changement alimentaire peut remodeler de manière reproductible le microbiote à travers une cohorte d’adultes en bonne santé. » Sa collègue Erica Sonnenburg, elle, admet que le résultat contredit l’hypothèse de départ. « Nous nous attendions à ce que les fibres aient un effet plus universellement bénéfique et augmentent la diversité du microbiote », a-t-elle expliqué, précisant que « les données suggèrent qu’une consommation accrue de fibres seule sur une courte période est insuffisante pour augmenter la diversité du microbiote. »

L’aspect immunitaire de l’étude mérite qu’on s’y attarde, tant il dépasse la simple question de diversité bactérienne. Chez le groupe aliments fermentés, quatre types de cellules immunitaires ont montré une activation réduite, et les niveaux de 19 protéines inflammatoires mesurées dans les échantillons sanguins ont également diminué. Parmi ces marqueurs, un nom revient souvent dans les publications scientifiques : l’interleukine 6, une protéine liée à des affections comme la polyarthrite rhumatoïde, le diabète de type 2 et le stress chronique. Christopher Gardner résume l’enjeu clinique de la découverte : « les régimes ciblant le microbiote peuvent modifier le statut immunitaire, offrant une voie prometteuse pour réduire l’inflammation chez les adultes en bonne santé. »

Pourquoi les fibres n’ont pas suffi

Voilà qui bouscule des décennies de discours nutritionnel où la fibre trônait en reine incontestée du microbiote. L’explication tient en partie à la biochimie : les fibres sont un substrat, pas un organisme vivant. Elles nourrissent des bactéries déjà présentes, mais n’en apportent aucune nouvelle. Les aliments fermentés, eux, livrent directement des souches bactériennes vivantes dans l’intestin, un peu comme si l’on ensemençait un jardin avec de nouvelles graines plutôt que de simplement arroser celles qui existent déjà.

Un détail technique éclaire encore ce constat : des taux de glucides plus élevés ont été retrouvés dans les échantillons de selles du groupe fibres, ce qui indique une dégradation incomplète des fibres par les microbes intestinaux. le microbiote de départ de ces adultes occidentaux, déjà appauvri par des années d’alimentation industrielle, n’avait tout simplement pas les bonnes bactéries pour digérer efficacement cet afflux soudain de fibres. Erica Sonnenburg envisage même une piste complémentaire : « il est possible qu’une intervention plus longue aurait permis au microbiote de s’adapter suffisamment à l’augmentation de la consommation de fibres », ou alors « l’introduction délibérée de microbes consommateurs de fibres pourrait être nécessaire. »

Ce constat ne condamne pas les fibres pour autant, il faut le préciser. Leur intérêt pour la santé cardiovasculaire, la satiété ou la régulation glycémique reste documenté par ailleurs. Mais pour espérer un effet rapide et mesurable sur la diversité bactérienne intestinale, dix semaines de légumineuses et de céréales complètes ne suffisent visiblement pas, du moins chez des adultes dont le microbiome est déjà appauvri par le mode de vie occidental.

Ce que ça change concrètement dans l’assiette

Concrètement, le protocole stanfordien donne une idée assez précise de ce à quoi ressemble un apport « efficace ». Une tasse de kimchi ou de choucroute équivaut à deux portions, une bouteille de kombucha du commerce à environ deux portions et demie, et 170 grammes de yaourt ou de kéfir à une portion. Le groupe qui a vu sa diversité microbienne progresser visait six portions quotidiennes, un objectif jugé exigeant mais réalisable par les chercheurs eux-mêmes. Pas besoin d’atteindre ce total dès le premier jour : mieux vaut monter en puissance progressivement, en variant les catégories (laitages fermentés, légumes lactofermentés, boissons fermentées) pour multiplier les souches bactériennes différentes qui arrivent dans l’intestin.

Reste une question que l’étude de Stanford, malgré sa rigueur, ne tranche pas entièrement : cette diversité gagnée se maintient-elle une fois le protocole terminé, ou retombe-t-elle dès qu’on arrête le kéfir du matin ? Les données de suivi disponibles suggèrent que les bénéfices s’estompent partiellement si la consommation de fermentés diminue, ce qui plaide moins pour une cure ponctuelle que pour une habitude installée dans la durée, à l’image de ce que pratiquent depuis des générations les cuisines coréenne, allemande ou caucasienne avec le kimchi, la choucroute et le kéfir.

Sources : yournews.com | sciencedaily.com